科属区别：海狸鼠隶属海狸鼠科、海狸鼠属。仓鼠隶属仓鼠科，是仓鼠亚科动物的统称。
外形区别：海狸鼠属于大型啮齿动物，算是放大版的仓鼠，它与仓鼠最明显的区别就是海狸鼠脚掌不是爪子，而是像鸭子一样有蹼。
生活习性区别：海狸鼠一般栖息在沼泽、湖泊和流动缓慢的溪流边，营穴居生活，对强光敏感。仓鼠广泛栖息于草原、农田、荒漠、山麓及河谷的灌丛，多在黎明和傍晚活动，喜独居。
温馨提示：海狸鼠属于野生保护动物，保护野生动物从自身做起，拒绝买卖野生动物制品，不干扰野生动物的自由生活。目前社会上存在的食用珍贵、濒危野生动物等行为，既是一种社会陋习，也是非法猎捕、杀害珍贵、濒危野生动物活动屡禁不止的原因之一。没有买卖，就没有杀害，杜绝食用野生动物，它们不属于餐桌。
一、科属区别
1、海狸鼠为哺乳纲、啮齿目、海狸鼠科、海狸鼠属动物。
2、仓鼠是哺乳纲、啮齿目、仓鼠科中的一个亚科，是仓鼠亚科动物的统称，目前发现的共有7属18种，其中中国有3属8种，通称仓鼠。
二、外形区别
1、海狸鼠是一种大型锯齿动物，体型大，短粗，体长430-635mm，尾长225-425mm，体重5-10kg，大的重达17kg。从外形看，海狸鼠就像放大版的仓鼠，但它们还是有明显的区别的，最明显的区别就是海狸鼠脚掌不是爪子，而是像鸭子一样有蹼。
2、仓鼠体型短粗，体长14-200mm，体重约30-1000g，腿短，脚宽，尾巴粗短。
三、生活习性区别
1、海狸鼠一般栖息在沼泽、湖泊和流动缓慢的溪流边，以茂密或多汁的植被沿岸区较多见，营穴居生活。多在早晨、黄昏和夜间活动，对强光敏感。夏季喜隐藏在草丛中，冬季喜晒太阳，在大风暴雨天气和异常天气停止活动。海狸鼠性情比较温顺，胆小好静，对外界反应比较迟钝。
2、仓鼠广泛栖息于草原、农田、荒漠、山麓及河谷的灌丛，也出入农田、花园和果园中，偶尔也进入房舍。多在黎明和傍晚活动，喜独居，当天气寒冷时，易出现伪冬眠的现象。它们有存储食物的习惯，无论食盘里有多少食物，都会放进颊囊中带到自己认为安全的地方。作为一种杂食性动物，玉米、坚果、蔬菜、水果都是它们的食物。