东海
启航篇（漫画：1－95话／动画：1话－47话）
受到四皇『红发』杰克的影响，蒙其・D・鲁夫开始出海当海贼。在冒险途中，原赏金猎人 罗罗亚・索隆、讨厌海贼的小偷 娜美、西罗布村的吹牛大王 骗人布以及海上餐厅「巴拉蒂」副主厨 香吉士陆续入夥，草帽海贼团就此成形。由於陆续击倒了在东海恶名昭彰的海贼们（包括『铁棒』亚尔丽塔、『小丑』巴其、『百计』克洛、『首领』克利克、『锯齿』恶龙等人），使鲁夫以新人之姿便具有3000万贝利的东海最高悬赏金。
罗格镇篇（漫画：96－100话／动画：48话－53话）
鲁夫一伙人到达了罗格镇，这是进入伟大航道之前必经的地方，也是『海贼王』哥尔・D・罗杰的故乡和后来被公开处刑的所在，因此这里又被称为「开始与结束的城镇」。在罗格镇，他们同时受到管辖这里的海军上校『白猎人』斯摩格和其他许多敌人的夹击，鲁夫在奔走过程中撞见了海贼王被处死的高台，兴奋的爬上高台眺望远方，却不小心被小丑巴其给擒住。巴其手上的刀即将招呼到颈间的那一瞬，他笑著对草帽海贼团的众人说：「对不起，我要死了！」，此情此景令斯摩格回想起二十年前海贼王的处刑（死前能够没有遗憾的笑，这样的人并不多）。也许是身处高处的缘故，巴其的刀凑巧引来了闪电劈向高台，身为橡胶人的鲁夫因为身体不导电而得救了，巴其则是暂时昏迷。返回船上的路上，鲁夫在镇上的入口处一度被斯摩格抓住，却又受到父亲『革命家』蒙其・D・多拉格的帮助而得以脱身（当时鲁夫并不知情）。离开罗格镇后，一伙人在伟大航道的入口――颠倒山之前以各自的梦想立誓，跨越颠倒山之后进入了伟大航道，展开下一段冒险。
阿拉巴斯坦事件
颠倒山篇（漫画：101－105话／动画：62－63话）
草帽海贼团一行人来到伟大航道 双子岬，在那里遇到一只等待留下它去了伟大航道的夥伴50年的『岛屿鲸』拉布，还有一位是曾在『海贼王』罗杰船上当过三年船医的可乐克斯（不过当时一行人并不知道可乐克斯曾在海贼王船上待过，现在的可乐克斯是双子岬灯塔看守员），还遇见神秘的二人组『Mr.9』和『Miss星期三』想取得拉布的肉当粮食，所幸及时被鲁夫阻止，本想逃跑的两人却不慎遗失了纪录指针而无法回到他们的基地，之后两人便请求刚得到新纪录指针的草帽海贼团搭船载他们回去。
威士忌山峰篇（漫画：106－114话／动画：64－67话）
在『Mr.9』和『Miss星期三』的带领下，草帽一行人来到威士忌山峰，在那里市民举行派对欢迎他们的到来。后来得悉威士忌山峰是秘密犯罪组织・巴洛克华克的地盘，在『Mr.5』和『Miss情人节』的追捕下发现『Miss星期三』和『Mr.8』的真实身份其实是阿拉巴斯坦王国公主 娜菲鲁塔利・薇薇和阿拉巴斯坦护卫队队长 伊卡莱姆，从公主口中得知阿拉巴斯坦正处於水深火热之中，以及王下七武海『Mr.0』沙・克洛克达尔的阴谋后，因此决定帮助这位公主（起初看在10亿贝里的份上，只是答应护送）后伊卡莱姆变装成薇薇的样子并带著前往阿拉巴斯坦的永久指针，设法假冒草帽海贼团直接回国，让一行人平安离开威士忌山峰，却仍被巴洛克华克派来的『Miss all Sunday』妮可・罗宾给识破，但Miss all Sunday没有接到任何要杀死薇薇的指令，并只将前往阿拉巴斯坦的永久指针交给草帽海贼团后就离开了，而鲁夫因不信任Miss all Sunday而将永久指针破坏，并依循原持有的记录指针往小花园前进。
小花园篇（漫画：115－129话／动画：70－77话）
鲁夫一行人来到小花园，那里是一个仍然保存著史前时代景观的巨大岛屿。但在那里有著比恐龙更加恐怖的东西，那就是已经在岛上决斗超过100年的两位巨人『青鬼』多利和『赤鬼』布洛基，众人更在此遇上了巴洛克华克的高级特务 『Mr.3』和『Miss黄金周』。『Mr.5』和『Miss情人节』也为了追杀草帽等人从威士忌山峰来到小花园与『Mr.3』搭档会合，草帽海贼团成功击败他们，而什N事都不知道的香吉士在狩猎比赛后发现大家都没回到船上，在找人的途中他来到Mr.3的蜡烛小屋，透过Mr.3的电话虫意外与『Mr.0』通电话，顺便打败了巴洛克华克底下的「不吉利二人组」，并且从他们身上取得前往阿拉巴斯坦的永久指针，一行人会合后两位巨人并以最强的绝招「霸国」在食岛怪身上开了个大洞，护送他们离开。
磁鼓王国篇（漫画：130－154话／动画：78－91话／剧场版9）
由於娜美得到一种不知名的病（其实是被在小花园的蚊虫叮咬），使得全员必须前往有医生的岛屿寻找医生，但在此时，他们又从三天前的报导中得知阿拉巴斯坦的内乱越来越严重，身为一国公主的薇薇担忧著国内一百万名国民的性命，因此希望在治好娜美的病后让船以最快的速度航向阿拉巴斯坦。於是一行人来到了有「医疗大国」之称的磁鼓岛，不巧的是磁鼓岛因为先前统治者的关系，使得岛上只剩下一个医生，那就是住在山上城堡里的『魔女』Dr.古蕾娃，鲁夫和香吉士背著重病的娜美为此踏上征山之途，途中受到一大群「食肉兔」和「雪崩」的影响，香吉士为了掩护鲁夫而受重伤，鲁夫带著两人徒手爬上Dr.古蕾娃所在的磁鼓山，但由於穿著单薄导致严重冻伤晕倒，三人一起接受了Dr.古蕾娃的治疗，并在此遇见了她的助手，一只蓝鼻子的驯鹿多尼多尼・乔巴，鲁夫想拉拢乔巴成为自己的夥伴，但乔巴因为过去的心灵创伤而不愿与人类接触，与此同时，前统治者 海贼团船长『白铁』瓦波尔刚好回到磁鼓岛来抢回他的国家。在经历与瓦波尔的战斗后，乔巴决定和鲁夫等人出海，乔巴以船医身份加入草帽海贼团。
阿拉巴斯坦篇（漫画：155－216话／动画：92－130话／剧场版8）
一行人和公主薇薇来到了阿拉巴斯坦，原先打算至叛乱军基地犹巴直接劝阻叛乱军首领 寇沙，抵达时却发现叛乱军已经离开。在鲁夫的决定下前往克洛克达尔的所在地雨地，得知其夺取国家的计画理想国后，便赶回首都阿尔巴那。在他们抵达阿尔巴那时，内战已经开始了，一行人为了使薇薇到达皇宫与巴洛克华克展开激战。鲁夫先后被克洛克达尔打败了两次，最后於遗迹里成功打败他，其他成员亦击败巴洛克华克的一众高级任务。而最后的一场雨使得薇薇得以向大家说明『Mr.0』克洛克达尔的阴谋，内战亦随之结束。其后薇薇和跑得快向鲁夫等人道别，就算脱离了海贼团但仍是夥伴之一。接著，原・巴洛克华克副社长妮可・罗宾，在解了鲁夫的毒后，因失去人生目标想寻死却被鲁夫所救，无处可去而被鲁夫收留，以考古学家的身份加入了草帽海贼团。
SKY PIEA篇
加亚篇（漫画：217－236话／动画：144－152话）
离开阿拉巴斯坦之后，想要前往下一个岛的草帽一伙人，意外发现一艘从天而降的大船，诡异的是纪录指针竟然向上指向天空。鲁夫也在大船上找到一张「空岛」的地图，先前没有预料到会有如此状况的一伙人来到了加亚岛，鲁夫、索隆、娜美三人前往岛西「魔谷镇」镇上的酒吧，想要打听有关空岛的线索，但遭到『鬣狗』贝拉密及其海贼团一伙人的嘲弄。贝拉密等人对鲁夫拳打脚踢，甚至讥笑所谓的空岛只不过是白日梦而已，但鲁夫对索隆说「这场架打不得」，以毫不还手诠释了他对梦想的坚信不疑。在酒吧外的『黑胡子』马歇尔・D・汀奇后来跟娜美解释：「这场胜负是你的夥伴赢了」，接著透过罗宾从魔谷镇得来的情报得知，加亚岛有个被居民逐出魔谷镇的怪老头库力凯似乎知道怎N到达空岛的方法，从岛西的城镇离开后，他们来到加亚岛东部的海岬，遇到了四百年前被称为骗子的''''蒙布朗・诺兰德''''的子孙‧猿山联合军船长 '蒙布朗・库力凯'，得知了上升海流下次的爆发地点在加亚岛南方后，全员前往森林想要捕捉一只指南鸟帮忙指引方向，回来后却发现库力凯的黄金遭到先前发生冲突的贝拉密强夺。虽然离出航时间只剩三小时，鲁夫还是冒著可能赶不上上升海流的风险，一个人跑到魔谷镇，一拳击倒了贝拉密并且抢回黄金。之后一行人前往上升海流的预定爆发地点，出发前往空岛。鲁夫一行人离开魔谷镇后，王下七武海 唐吉诃德・多佛朗明哥现身，操控贝拉密一伙人当中的『大匕首』萨奇斯，将身为手下却失职而玷污了自己名誉的贝拉密杀死。
空岛篇（漫画：237－302话／动画：153－195话）
乘著上升海流，一行人来到了海拔一万公尺高空的「白白海」。他们发现空岛并不只是原本他们想像的黄金乡而已，大夥原本冀望能够在空岛享受不用担心海军的愉快时光，却莫名其妙被冠上了非法入国的罪名，被迫接受「神之岛」阿帕亚多上四神官们的「试炼」考验。在试炼的过程当中，众人根据分头探索的经验得出了结论：四百年前，诺兰德口中的黄金乡并不是沉没到海底，而是因为上升海流的关系使原本的加亚岛一分为二，一半到了这「白白海」上――也就是说，这神之岛就是原本的加亚，而那只有一半的房屋更是支持这个推论的铁证。前任的神 『天空骑士』甘・福尔则是因为从一伙人得知了阿帕亚多的来由，明白了岛上天使们和香狄亚人四百年的战乱的来龙去脉。另一方面，拥有自然系 轰雷果实 雷能力的『神』艾涅尔，在神之岛设计了一场81人的生存淘汰赛，并且预言能存活下来的只有5个人，而草帽一伙人则在黄金前夜祭之后加入了这场淘汰赛，三小时后，罗宾、索隆、娜美、甘・福尔以及香狄亚战士瓦夷帕等五位参赛者出现在艾涅尔面前，艾涅尔也娓娓道出了自己目的，其实他真正的计划是打造一艘大型飞船方舟「箴言」，并带著来自古早香狄亚人打造的巨大黄金钟楼前往「无限大地」，同时将空岛打回青海，参赛者们得知后纷纷站出来反抗艾涅尔，却都败在那无敌雷能力之下，而唯一幸存的娜美为了保命，假借自愿跟随艾涅尔前往无限大地，一方面找寻逃生的机会，原以为计画完美无缺的艾涅尔却漏算了被大蛇吞下肚的鲁夫，不久鲁夫逃出大蛇身体，看到夥伴们的惨状气愤不已，当下冲向艾涅尔停靠方舟的地方，巧合的是由於空岛没有「橡胶」，鲁夫不导电的橡胶体质反成了艾涅尔最棘手的天敌，两人纠缠了好几回，艾涅尔最终仍被击败。鲁夫也敲响了巨大的黄金钟，让天空的住民们听到四百年前的「岛的歌声」重现，终於解开了两族的心结，也终止了长达四百年的战争。同时，因为罗宾解读了历史本文的文字，明白了原本香狄亚人守护历史的任务已经该交给对历史有所认知的自己，香狄亚人的历史包袱也就能够放下。
司法之岛事件
长环岛篇（漫画：303－321话／动画：207－228话）
结束空岛的冒险后，草帽海贼团在海上遇到一艘既没有帆也没有旗帜的海贼船，还因为少了指挥一切的船长和航海士让船员变的没有组织性，整艘船并在一行人面前遭到海猴子引起的巨浪吞噬，接著他们来到了长环岛，遇到狡猾的海贼团船长『银狐』弗克西，拥有「迟缓果实」能力的弗克西向鲁夫挑战「Davy Back Fight」比赛，胜利者可以从败方选择得到一名成员或选择标志（被夺走标志后不得再挂上该标志，以及被夺走的同伴、标志等，都必须在由「Davy Back Fight」夺回），草帽海贼团与弗克西海贼团比了两场，分别为「环形赛船」以及「火爆斗球」，在一胜一败的情况下进入第三场也就是最后一场的比赛，第三场是「双方船长一对一决斗」，弗克西的迟缓能力一度让鲁夫居於劣势，最后因为想要守护所有夥伴的心意以及爆炸头的野性力量爆发让他战胜了弗克西。事情结束后，他们又遇上了海军本部上将『青雉』库山，而他的目的，就是要歼灭曾经从他手中逃走的罗宾。为了保护罗宾，一行人和这个可怕的强敌战斗，败得一蹋糊涂，最后却被放过一马，遭到青雉「冷冷果实」能力攻击导致全身被冰冻的罗宾和鲁夫，则在团员们的合力抢救下捡回一命。
水之七岛前篇（漫画：322－345话／动画：229－241话）
草帽一行人在罗宾和鲁夫痊愈后，为了寻找船匠夥伴和修理梅利号而来到以造船出名的水之七岛，但本来与乔巴在镇上逛街的罗宾却突然失踪了，而寻找船匠的鲁夫、娜美和骗人布在前往卡雷拉公司时所换得的2亿贝里遭佛朗基家族抢走，提著2亿贝里的骗人布，为了夺回2亿贝里也被他们打成重伤，为此鲁夫、索隆、香吉士、乔巴前往佛朗基之家报此仇，但家族头头佛朗基已经带著两亿贝里前往黑市，四人痛扁佛朗基的小弟们，并且毁了佛朗基之家。梅利号在经船匠检查过后发现已经不能航行，鲁夫以船长的立场决定更换一艘新船。骗人布对鲁夫这突如其来的决定感到相当震怒，与鲁夫决斗最后战败然后离开了他们。水之七都市长 ICE・BARG遭到袭击，而攻击ICE・BARG的人似乎就是罗宾，草帽海贼团成了水之七都岛民和船匠追杀的对象，佛朗基也因为自己的家被鲁夫破坏、小弟被打伤一事，想找草帽海贼团算帐，罗宾则在事发后的第二天出现在要找她的香吉士和乔巴面前，发出了要退出草帽海贼团的宣言，鲁夫等人为了从罗宾口中问出想退出海贼团的原因，决定当晚上潜入ICE.BARG宅邸。
罗宾争夺战篇（漫画：346－374话／动画：242－262话）
草帽海贼团进到ICE.BARG宅邸发现幕后驱使罗宾的主谋，竟是世界政府直属秘密间谍机关「CIPHER POL NO.9」，但因为他们超人般的力量「六式」使众人很快就吞下败仗，CP9逼问ICE.BARG冥王设计图的去向，并以假设手法得知应该在佛朗基那，刚好骗人布也在佛朗基那里，两个人就跟罗宾一起被抓上海列车「冒烟汤姆」。娜美也从ICE.BARG口中得知了一件惊人的真相，原来罗宾之所以背叛草帽海贼团是为了让他们平安离开水之七岛，打从心理将草帽海贼团成员视为重要夥伴的罗宾，打算牺牲自己的性命来保护夥伴们免於受到世界政府「非常召集」攻击，於是草帽海贼团、佛朗基家族与卡雷拉公司等人决定要去救回牺牲自己的罗宾和被抓走的佛朗基，而和众人暂时分开行动的香吉士则潜入了海上列车，解放了骗人布和佛朗基，与各「CP」进行激烈的争夺战，佛朗基为了让香吉士他们顺利把罗宾带回去而牺牲自己让CP9给抓回去，但罗宾却仍选择了离开众人，和CP9一起到司法之岛「艾尼爱斯大厅」。
司法之岛篇（漫画：375－430话／动画：263－312话）
一行人来到了世界政府辖下的司法之岛「ENIES LOBBY」，佛朗基安排让罗宾与鲁夫见面，但罗宾仍不愿意回到夥伴身边，甚至告诉鲁夫自己已经不想活了，罗宾揭露出世界政府的阴谋及以往的所作所为，害她家破人亡，甚至被逼的走投无路而想寻死，得知罗宾痛苦的草帽海贼团当著司法岛所有人面前，烧毁了代表世界政府的旗帜（向全世界宣战），此举让罗宾当场放声痛哭，并且大喊出了压抑在心中许久的心愿-「想要活下去」，后来一行人趁著海列车「火箭人」冲进司法之塔之时成功救回佛朗基，但却没有救回罗宾，封住罗宾行动的「海楼石手铐」钥匙在其中一名CP9手中(有5条钥匙)，CP9长官 斯帕达姆以此战术藉机拖延鲁夫他们救走罗宾的时间，一行人为了抢到正确的钥匙展开与CP9的战斗，经过一番激战后打击败了CP9并且成功解放罗宾，「s史上最强的CP9」罗布・路基也终於被鲁夫击败，CP9八百年来的传颂不败神话也被破灭了，但在鲁夫受到路基使出的「六王枪」所成致命伤无法动弹以及抢来的逃脱船被炸毁的情况下，众人被海军战舰包围陷入困境，所幸重要的夥伴梅利号出现拯救了所有人，虽然海军战舰集中炮火攻击梅利号，却因香吉士关闭「正义之门」产生的涡流而受困，草帽海贼团顺利逃出了ENIES LOBBY，本次战役是海军有史以来最大的完败。
水之七岛后篇（漫画：431－441话／动画：313－325话）
司法之岛篇结束后，梅利号突然断成两截，前来接送的ICE.BARG告诉鲁夫一行人，这是他为了达成梅莉号的心愿而做了临时补强，现在则是该道别的时候，一行人挥泪火葬梅利号，回到水之七都，佛朗基表示希望用当初抢来的两亿贝里替鲁夫他们造一艘新船，在等待新船完成的期间，新的报导与悬赏单也随之发布下来，因为在司法之岛的轰烈事迹，使全船人都遭到悬赏，『草帽』蒙其・D・鲁夫3亿贝里、 『海贼猎人』罗罗亚・索隆1亿2千万贝里、『小偷猫』娜美1千6百万贝里、『狙击之王』3千万贝里、『黑脚』香吉士7千7百万贝里、『超爱棉花糖』多尼多尼・乔巴50贝里、『恶魔之子』妮可・罗宾8千万贝里、『铁人』佛朗基4千4百万贝里。与在此时，鲁夫一行人商讨骗人布事后想归队的问题，但因为骗人布当初的意气用事让鲁夫差点下不了台，因此鲁夫决定要等待骗人布的道歉，否则之后的出航他们将把骗人布扔在水之七岛。及后佛朗基帮鲁夫他们造了一艘新船「千阳号」，船匠 佛朗基也正式加入了草帽海贼团。而罗宾亦打开了幼年的心结，成为草帽海贼团真正的夥伴。骗人布诚心道歉后，也回到草帽海贼团，这时回顾到前几天，白胡子海贼团第二队长『火拳』波特卡斯・D・艾斯正与海贼团船长『黑胡子』马歇尔・D・汀奇在巴纳洛岛上激战，两人之间的胜负成为了日后某起「大事件」的导火线。
航向鱼人岛篇
恐怖三桅帆船篇（漫画：442－489话／动画：337－381话）
草帽海贼团捡到一个祭祀海神的酒桶，打开后里面竟冲出诡异的红色闪光，接著千阳号因暴风雨而航行到魔幻三角地带，在那里遇见吃了黄泉果实的神秘骷髅人布鲁克，就在他们和布鲁克对话时，船渐渐驶向世界最大海贼船「恐怖三桅帆船」 ，从以前就想要个音乐家的鲁夫邀请布鲁克成为同伴，但由於失去「影子」的布鲁克不能照射到阳光，因此拒绝了鲁夫的入团邀请，并一个人跑到岛上，因为娜美、骗人布和乔巴在岛上迷路，好奇心作祟的鲁夫不顾布鲁克要他们离开此地的劝告，硬是和夥伴们闯进去探险，然而居住在恐怖三桅帆船里的竟然是王下七武海 月光・摩利亚，为影子果实能力者，并且抢走敌人的影子建立僵尸军团，草帽海贼团成员陆续被摩利亚抓住并且剥走了影子，落单的罗宾和佛朗基在即将被僵尸军团抓住之际得到布鲁克的帮助，经被僵尸称为「剑侠鼻呗」的布鲁克的解说，从而得知恐怖三桅帆船的秘密与僵尸的弱点，两人并带著布鲁克给他们的「盐」成功救出骗人布和乔巴，并且回到千阳号上唤醒了被夺走影子的鲁夫等人，但娜美还被困在岛上，得知布鲁克和在双子岬遇到的『岛屿鲸』拉布有一段约定，鲁夫一行人为了抢回食物、娜美和大家的影子再次闯入摩利亚的宅邸，鲁夫想只身去找摩利亚要回影子，其他人则与服仕摩利亚的三怪人和僵尸大军展开了艰辛的战斗，最后他们面对的最强敌人，是装有鲁夫影子的特别僵尸『魔人』欧斯，欧斯拥有与鲁夫同等破坏力，却也因鲁夫的白痴性格而数度被草帽海贼团成员耍的团团转，但由於摩利亚甩掉鲁夫后中途加入战局，使欧斯成为「力量」加「头脑」的凶恶怪物，草帽海贼团面临全军覆没的危机，所幸身上塞的一百人份影子的「噩梦・鲁夫」及时出现，加上同伴们的齐心合力，最终仍将摩利亚和欧斯逼到绝境打败了他们，但事情并未就此结束，他们遇上了王下七武海『暴君』巴索罗缪・熊，熊听从世界政府的指令，抹杀所有目睹摩利亚被击败的目击者，面对强大的力量加上体力耗尽，全团均无能为力并处於劣势，几乎全部被冲击晕倒，仅剩下索隆尚能勉强战斗。为了鲁夫的梦想索隆愿意牺牲生命以换取鲁夫头颅，面对如此友情熊只得网开一面放过他们一马，将鲁夫所有的痛苦和疲劳转到索隆身上。事情结束后，布鲁克为了完成和拉布的约定，以音乐家身份加入草帽海贼团。
迪巴鲁篇（漫画：491－495话／动画：386－389话）
离开「魔幻三角地带」后，已经航行伟大航道半圈的草帽海贼团终於看到了「红土大陆」，大夥对一直以来的辛苦航行而获得的代价感到相当欣慰，接著为了寻找到鱼人岛的线索，他们利用「鲨鱼潜水3号」潜入海底探索却无功而返，此时一只直追鲨鱼潜水3号的海兔跳出海面攻击草帽海贼团，鲁夫打倒海兔之后，意外遇见从海兔嘴里掉出来的人鱼海咪和海星帕帕克，两人拜托草帽海贼团从绑架集团「飞鱼骑士」以及马可罗海贼团手中救出在章鱼烧店工作时很照顾她的老板 八仔，一行人来到飞鱼骑士团的大本营后意外发现海咪口中的八仔是元・恶龙海贼团干部『六刀流』八，而「飞鱼骑士」首领『铁面具』迪巴鲁似乎和草帽海贼团有著什N深仇大恨，在与飞鱼骑士团的战斗中，鲁夫一脚踢开了迪巴鲁的铁面具，没想到他竟然因为和香吉士悬赏单上的脸长得几乎一模一样，才会因此遭到海军的追杀，最后在香吉士「整形踢」下将迪巴鲁整形成一个帅哥，飞鱼骑士团就此和鲁夫一行人化敌为友。
夏波帝诸岛（漫画：496－513话／动画：390－405话）
得知鱼人岛位在海底 10000公尺深处，为了让千阳号能在海底航行，需要在船表面上膜，草帽海贼团、海咪、小八、帕帕克一行人来到香波地诸岛，目睹了世界贵族「天龙人」滥用权力的恶行，以及岛上奴隶制度盛行的丑恶行为，接著他们来到小八的老友 夏姬开的风情酒吧要拜访上膜工人，但上膜工人已经半年没回家了，夏姬并提供几个他常去的地方给鲁夫等人作参考，并透露鲁夫和索隆已经被列为海贼界超新星十一人，另外九位赏金破亿的通缉犯同时也登陆了这座岛，在寻找上膜工人的途中海咪被绑架集团「猎狗宠物团」绑走了，草帽海贼团召集飞鱼骑士团将他们载到「人类拍卖会场」，后来在会场上小八被天龙人开枪射击，鲁夫愤而打伤天龙人，导致天龙人事件发生，一行人得到上膜工人「老雷」的帮助而顺利离开人类拍卖会场，回到夏姬的酒吧后，一行人才得知原来「老雷」是罗杰海贼团副船长『冥王』席尔巴兹・雷利，为感谢鲁夫等人帮助小八，雷利答应替千阳号免费上膜，并给他们每人一张「生命纸」，接下来给船上膜的三天时间全员得在岛上躲避海军，而受天龙人事件影响，海军本部上将『黄猿』博尔萨利诺来到香波地诸岛，所幸『冥王』雷利来此帮助，但也引发混战，后来全团船员更被突然出现的『暴君』熊的能力传送到别的地方去。而在同时，海军本部也正在召集所有王下七武海，准备要和白胡子海贼团战斗。
大事件篇
女儿岛篇（漫画：514－523话／动画：408－421话）
鲁夫被大熊传送到女儿岛 亚马逊・百合，鲁夫食物中毒，并为玛格丽特及同伴所救。但因他不知女人岛上不准男人靠近的规定，且「劫持」了玛格丽特而遭到追杀，而后更在那遇上了自称因为「诅咒」而拥有「石化」能力的女性王下七武海『海贼女帝』波雅・汉库克，面对这个狠心把自己人石化的美艳暴君、目击此事却无动於衷的女人国子民、以及两位同样自称受诅咒其实是吃了恶魔果实的女王之妹，鲁夫展开了在女儿岛的战斗，后化解了与女儿岛居民的冲突和女帝的心结后，鲁夫无意中从怎N了婆婆那得知艾斯的困境，决定去深海监狱「推进城」拯救即将被处死的『火拳』艾斯。而此时汉库克因暗恋上鲁夫，所以决定利用七武海身份暗中帮助他。另外，本篇也短暂说明了在鲁夫来到女儿岛的前几天草帽海贼团其他同伴的去向。
“ONE PIECE”在故事中为“一个大秘宝”之意。故事描述男主角‘草帽’蒙其・D・路飞为了当上“海贼王”而踏上“伟大航道”及与其伙伴的经历。传说中‘海贼王’哥尔・D・罗杰在死前说出他留下了具有财富、名声、力量世界第一的宝藏“ONE PIECE”，许多人为了争夺“ONE PIECE”，争相出海，许多海贼开始树立霸权，而形成了“大海贼时代”。十年后，路飞为了要实现与因救他而断臂的四皇‘红发’香克斯的约定而出海，在遥远的路途上找寻着志同道合的伙伴，一起进入“伟大航道”，目标当上“海贼王”。
路飞在某个海岛小渔村长大，和暂驻在渔村的大海盗红发撒古斯感情很好，于是一心想成为海盗。眼下的 疤痕就是为了显示自己够狠自己用刀划的。可是路飞7岁时糊里糊涂的吃了海盗们抢来的 恶魔果实――橡皮果实（ゴムゴムのg），从此再也学不会游泳。这样还能成为海盗吗？路飞的答案是― ―只要不掉到海里就可以了（听上去好像很有道理，可是……我真的给这个单细胞的家伙打败了）。 “想要我的财宝吗？想要的人…就到海上找找看吧！我把它们都放在那里！”这是威震四海，曾拥有整个世界财富的海贼王格尔 罗杰在临刑前说的最后一句话，就因为这句话，使得全世界的人都源源不断地冲向大海，于是，大海贼的时代来临了。 蒙其 D 路飞――一个以成为海贼王为目标的男孩，为了兑现与救了他命的杰克的承诺，戴着杰克留给他的草帽只身一人向着大海出发了！可路飞却因小时候误食了恶魔果实而无法游泳了，就是在这种情况下，路飞展开了他的冒险……一路上他先后结识了一位又一位可靠的伙伴，打倒了一个有一个强大的敌人，经历一次又一次殊死的恶斗，路飞也离那财宝“ONE PIECE”越来越近了……[+展开][-收起]
故事描述男主角‘草帽’蒙其・D・路飞为了当上“海贼王”而踏上“伟大航道”及与其伙伴的经历。传说中‘海贼王’哥尔・D・罗杰在死前说出他留下了具有财富、名声、力量世界第一的宝藏“ONE PIECE”，许多人为了争夺“ONE PIECE”，争相出海，许多海贼开始树立霸权，而形成了“大海贼时代”。十年后，路飞为了要实现与因救他而断臂的四皇‘红发’香克斯的约定而出海，在遥远的路途上找寻着志同道合的伙伴，一起进入“伟大航道”，目标当上“海贼王”。